新晃侗族自治县的主要地貌是山地。东南、西南和北部地势高，东北地势低，位于云贵高原苗岭山脉余脉延伸末端，雪峰山脉以西，武陵山脉以南，是中国第二阶梯到第三阶梯过渡地带。新晃侗族自治县海拔一般是400米至800米之间，东南部最高点天雷山海拔1136.3米，连接1000米以上的山峰14座，形成了东南屏障。西南部美岩破海拔1101.5米，连接海拔1000米以上的山峰11座。北部武陵山余脉缓缓下降到㵲阳河，波洲镇江口村是新晃侗族自治县最低点，海拔只有287.7米，因这里属溪水平原、灰岩岗地分布区，历代都是政治、经济、文化、交通中心。
平均海拔：562 米
